ความเครียดเฉพาะที่ผู้ป่วยติดเชื้อมีผลต่อการรักษาของพวกเขา บางสายพันธุ์มีความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะในขณะที่คนอื่นมียีนที่ทำให้การติดเชื้อแย่ลง หนึ่งในความแตกต่างที่สำคัญระหว่างสายพันธุ์เหล่านี้คือไม่ว่าจะเป็นเชื้อแบคทีเรียที่ติดเชื้อจากไวรัส ระบบภูมิคุ้มกันของแบคทีเรียที่เรียกว่าระบบ CRISPR / Cas ป้องกันไม่ให้ติดเชื้อจากไวรัส

นักวิจัยวิเคราะห์ระบบภูมิคุ้มกันนี้ภายในP. aeruginosaในกลุ่มผู้ป่วยโรคปอดเรื้อรังที่คลินิกในโคเปนเฮเกนเดนมาร์กและพวกเขาพบว่าโปรไฟล์ภูมิคุ้มกันของแบคทีเรียมีความหลากหลาย ประชากรแบคทีเรียในโคเปนเฮเกนดูเหมือนความหลากหลายทั่วโลก ภายในคน ๆ หนึ่งมันไม่ได้มีความหลากหลาย แต่ภายในชุมชนนี้ภายในโรงพยาบาลแห่งนี้มันก็เป็นเช่นนั้น จากนั้นพวกเขาต้องการดูว่าพวกเขาสามารถระบุได้หรือไม่ว่าไวรัสตัวใดมีโอกาสติดเชื้อแบคทีเรียกลุ่มนั้น พวกเขาเปรียบเทียบประชากรแบคทีเรียกับไวรัสที่เป็นที่รู้จักของP. aeruginosaและพบว่าไวรัสบางตัวมีการกำหนดเป้าหมายอย่างสูงจากระบบภูมิคุ้มกันของแบคทีเรียในขณะที่คนอื่นไม่ได้